Under regnperioden, som infaller mellan maj och november, kan El Salvador drabbas av tropiska stormar och orkaner samt kraftig nederbörd som kan medföra översvämningar och jordskred. Resenärer uppmanas iaktta försiktighet vid resa i drabbade områden och hålla sig väl informerade om framkomligheten på landets vägar under denna period.

Seismologisk aktivitet förekommer i El Salvador och mindre jordskalv är vanligt förekommande.

El Salvadors räddningstjänst

La Dirección General de Protección Civil, Prevención y Mitigación de Desastres de El Salvador, allmänt känd som "Protección Civil", är den statliga organisation som samordnar arbetet med katastrofhantering, räddning och förebyggande åtgärder mellan brandkåren, polisen, ambulansen och en stor mängd myndigheter.