Genom hela Kenya sträcker sig dalsänkan Rift Valley. Det finns gott om vulkaniska berg men dessa är inte aktiva. Kenya ligger vid en förkastningslinje och jordskalv kan förekomma, den senaste av större magnitud ägde rum 2007.

Under regnperioderna (ungefär slutet av mars till juni samt oktober till november) är risken för översvämningar och jordskred i vissa områden påtaglig. Framkomligheten och sikten på vägar kan då försämras drastiskt och på kort varsel. Man bör bekräfta vägars framkomlighet innan man reser iväg. I samband med kraftiga regn och översvämningar ska man undvika att gå eller åka bil genom floder och stora vattenmassor.