På grund av den förvärrade säkerhetssituationen i hela Sahelområdet de senaste åren är risken för terrorbrott och väpnad kriminalitet förhöjd i hela Niger. Aktiviteter av islamistiskt våldsfrämjande grupper såsom AQIM (Al-Qaida i Islamiska Maghreb) och Ansar Dine, verksamma främst i norra Mali, spiller över på Niger och då framför allt i gränsområdena mot Mali, Algeriet och Libyen. Kidnappningar av västerlänningar har förekommit, antingen i gruppernas egen regi eller tillsammans med kriminella grupper. 

Den islamistiska terrorrörelsen Boko Harams aktiviteter i norra Nigeria har drivit många människor på flykt, bland annat till Niger. Regionerna Zinder och Diffa, inte minst området kring Tchadsjön, är särskilt drabbade.